Fin mai 1940, la région des Moëres et de Bulskamp se trouvait sur la ligne de front lors de la retraite vers Dunkerque. Les troupes britanniques y opposèrent une forte résistance pour permettre l’évacuation des soldats alliés par la côte (opération Dynamo). Ces combats et bombardements, aujourd’hui peu connus, firent des victimes parmi les militaires et les civils. Leurs tombes, au cimetière de Bulskamp, rappellent cette période. C’est alors que le château La Cense, situé sur le domaine de La Compagnie des Moëres, fut détruit par un incendie. Il ne fut reconstruit qu’après la guerre, sous la forme de la maison située au centre du domaine.

Fin 1943, les occupants allemands craignaient un débarquement allié sur les plages du Pas-de-Calais. En janvier 1944, le maréchal Rommel ordonna d’inonder les zones basses à l’arrière du littoral. L’objectif était de pouvoir se retrancher à Dunkerque en cas de débarquement ou de libération, tout en empêchant les Alliés d’utiliser le port. Les habitants des Moëres durent quitter leurs villages avant le 15 février. Les Moëres françaises furent inondées dès février ; la partie belge fut épargnée jusqu’au 23 mars. Une digue près de la frontière fut rompue et les vannes du Ringsloot ouvertes. Le niveau de l’eau monta rapidement. Les bâtiments actuels de La Compagnie des Moëres — la grange, l’ancienne maison de ferme et la conciergerie — restèrent sous jusqu’à deux mètres d’eau pendant plusieurs mois. L’ancienne habitation agricole fut détruite. En compensation, les familles d’agriculteurs reçurent un « Moerhuisje ». Notre maison de vacances pour six personnes, comme 27 autres maisons similaires, témoigne encore de cette époque. Il fallut attendre trois ans après la guerre pour reprendre les récoltes, après avoir désalinisé les terres agricoles à la chaux.